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枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建
中文名称: 枣种质资源遗传多样性的分子评价及其核心种质的构建
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论文编号: 3767225收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Studies on Genetic Diversity and Core Collection Construction of Ziziphus Jujuba Germsplasm Resources Using AFLP and SRAP Markers
学位类型: 博士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 果树学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 种质资源 遗传多样性 AFLP SRAP 核心种质 亲缘关系
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文简介:枣是原产我国的重要果树,种质资源极其丰富,遗传背景复杂。枣种质资源的研究涉及形态学、孢粉学、生物化学、分子生物学等领域,经历了从形态多样性到DNA多样性的发展过程。由于缺乏系统研究,对枣种质资源的亲缘演化关系目前仍不很清楚,尤其在核心种质构建方面的研究几乎为空白。本研究应用AFLP和SRAP分子标记技术对177份枣种质资源的亲缘关系、遗传多样性进行了分析,构建了枣的核心种质,为枣的分类、遗传育种和种质资源保存提供了有力证据,主要研究结果如下: 1.确定了适合AFLP分析的枣基因组DNA提取方法为改良CTAB法,在细胞核裂解之前,用CTAB-free缓冲液对叶片组织匀浆洗涤后再进行DNA提取,可有效克服多糖等次生代谢物质对提取的干扰;加大CTAB浓度,用3×CTAB作为裂解液;在用无水乙醇沉淀DNA之前,用高浓度NaCl再次分离多糖。粗提后的DNA经RNase处理去除RNA,氯仿/异戊醇抽提去除蛋白质,得到了基本无降解、无污染、高分子量的枣基因组DNA。 2.从120对AFLP引物组合中选出17对谱带清晰、多态性高的引物组合。对177份枣种质资源进行扩增分析,共扩增出577条电泳谱带,平均每对引物产生34条谱带,其中372条为多态性带,多态性比率为64.47%;其余205条谱带为所有材料共有,占35.53%。供试样品间的遗传相似系数在0.761~1.000之间。圆铃与酥圆铃之间遗传相似系数最大,为1.000;秤砣枣与酸枣1之间的遗传相似系数最小,为0.76l。 3.构建了供试材料的AFLP指纹图谱,部分供试材料具有独有的特征带,其余材料可通过二歧分类法确定各自在AFLP图谱中的差异带,根据样品的特征带或差异带可区分开所有的供试材料。 4.利用6对SRAP引物组合对177份枣种质进行扩增,共扩增出113条谱带,平均每对引物能扩增出19条谱带。其中51条带为所有材料共有,占45.13%;其余62条均为多态性带,多态性检出率为54.87%。供试样品间的遗传相似系数范围在0.727~1.000之间。圆铃与酥圆铃,无头枣与襄汾圆枣,义乌大枣与南京枣,壶瓶酸与壶瓶枣,大马牙与葫芦长红,金丝小枣与金丝蜜,赞新大枣、赞皇大枣1与赞皇大枣2之间遗传相似系数最大,均为1.000:新疆小圆枣与永城长红,小平顶与核桃纹,小木枣与短果长红之间的遗传相似系数最小,均为0.727。 5.采用UPGMA法对供试材料的AFLP数据、SRAP数据和AFLP与SRAP整合数据进行聚类分析,聚类结果与枣种质地理来源关系密切。 6.基于AFLP和SRAP分析结果,在分子水平上,探讨了几组枣品种的亲缘演化关系: ⒈酥圆铃与圆铃可能是同物异名;老婆枣可能是由核桃纹演化而来;延川狗头枣与圆铃的亲缘关系较近。 ⒉磨盘枣与圆铃枣品种群的亲缘关系较近,是由圆铃枣演化而来。 ⒊宣城尖枣、义乌大枣与南京枣亲缘关系较近,推测为同一近缘系。 ⒋宁阳六月鲜、孔府酥脆枣和疙瘩脆亲缘关系较近,推测为同一近缘系。 ⒌葫芦长红与大马牙的亲缘关系极近;短果长红与其他长红枣品种群的品种的亲缘关系稍远。河南龙枣与河北龙枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系,是由长红枣演化而来;串铃与长红枣的亲缘关系较远,并不属于长红枣品种群。 ⒍大名布袋枣与尜尜枣亲缘关系较近,推测为同一近缘系。 ⒎金丝小枣品系间的差异是DNA水平的差异;天津快枣、二秋枣、缨络枣、郎家园枣、长木枣、小木枣、马铃脆和金丝小枣的关系较近,是金丝小枣品种群的组成部分;无核小枣是由金丝小枣演化而来。 ⒏馒头枣、沧县傻枣、大白铃、大瓜枣、大荔鸡蛋枣、溆浦鸡蛋枣、涪陵鸡蛋枣与临猗梨枣具有较近的亲缘关系,推测它们为同一近缘系。 ⒐敦煌大枣和临泽大枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系。 ⒑临泽小枣和中宁小枣亲缘关系极近,推测为同一近缘系。 ⒒大王枣、薛城冬枣和雪枣的亲缘关系较近。 ⒓赞皇大枣株系间的差异是DNA水平的差异。 ⒔婆枣株系问的变异程度较大;泡泡红、串干、沙枣与婆枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。 ⒕灵宝大枣和屯屯枣的亲缘关系较近,差异应该属于品种内株系间的差异。 ⒖小平顶和朝阳圆枣的亲缘关系较近,为同一近缘系。 ⒗胎里红和三变红的亲缘关系较远,并不是同一个品种。 ⒘蒲城晋枣和耙齿枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。 ⒙稷山圆枣和柳罐枣的亲缘关系较近,可能为同一近缘系。 ⒚茶壶枣与扁核酸的亲缘关系较近,推测茶壶枣可能是由扁核酸变异而来。 ⒛日出、红颜和福枣3个韩国品种与中国枣品种亲缘关系较近,3个品种之间的遗传差异较大。 7.根据AFLP和SRAP数据整合后的聚类结果,对166个枣品种采用3种方法构建核心种质,比较了等位基因数、有效等位基因数、Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数,表明采用逐步聚类法构建的枣核心种质代表性较好。枣核心种质包括50份资源,观测等位基因数、有效等位基因数、Nei's遗传多样性指数和Shannon's信息指数的保留率基本在95%以上,核心种质能很好的代表初始种质。
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