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人脐静脉内皮细胞基因表达谱分析
中文名称: 人脐静脉内皮细胞基因表达谱分析
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论文编号: 3122071收藏本论文】【我的收藏】【我要投稿
英文名称: Analysis of Genes Expression of the Human Umbilical Vein Endothelia Cells
学位类型: 博士毕业论文
作者: 涉及隐私,隐去***  作者本人请参看权力声明>>
导师: 涉及隐私,隐去***
毕业学校: 涉及隐私,隐去***
专业: 内科学
毕业年份: 涉及隐私,隐去***
关键字: 内皮细胞 人脐静脉 基因表达谱 基因芯片 人脐静脉内皮细胞 信号通路 生理功能
简介目录: 点击此处 免费索取本论文简介和目录>>
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论文简介:研究背景: 内皮细胞在人类许多重大疾病发生过程中处于重要的地位,例如冠心病、肿瘤等。冠心病是由于冠脉血管病变导致心肌细胞缺血、缺氧,使该支冠脉血管(包括微循环)及所支配区域的心肌细胞凋亡、坏死,其中内皮细胞的的应激、炎症反应、脂质沉积等病理生理过程是冠心病发生的重要机制。在肿瘤尤其是实体瘤的发生过程中,血管新生是肿瘤得以存活的重要因素,而血管新生的最主要过程即为内皮细胞的生长,另外肿瘤的侵袭、转移等过程,也有赖于内皮细胞的参与。因此可以看出,内皮细胞在这些关乎人民健康的重大疾病的发生过程中占有重要的地位。 基因在疾病的发生发展过程中处于重要的地位已成为科学界的共识。基因表达的改变在内皮细胞病变的过程中处于什么地位?发挥什么作用?——长期以来就是医学领域中研究的重点和热点。当前,对于内皮细胞基因表达方面的研究较多,但是尚未见将内皮细胞全部基因表达谱进行全部分析的报道。若能将内皮细胞的所有表达基因进行分析,汇总和分类,分析这些表达基因所参与的病理生理功能及在内皮细胞中所发挥的作用,那将对基因治疗运用于内皮细胞具有重要的意义。 目的: 利用当前基因芯片高通量技术,全面分析人脐静脉内皮细胞的基因表达谱,对所有表达的基因进行生物信息学分析,汇总整理出与内皮细胞相关的重要的基因、分子功能和信号通路。 方法: ⒈应用人类HG-U133Aplus2.0芯片对人脐静脉内皮细胞的基因表达谱进行全面分析,进而就用荧光定量PCR方法对结果进行验证。 ⒉应用MicrosoftExcel、Milano、Go、PANTHER以及Genomatix等软件和网站对基因表达谱进行分析、汇总及数据挖掘。 结果: ⒈3张芯片所表达的基因 分别为21019个(占基因 总数的38.5%)、20339个(占基因 总数的37.2%)、21124个(占基因 总数的38.7%)。 ⒉荧光定量PCR验证5个基因,与芯片结果一致。 ⒊3张芯片交集均表达的基因芯片ID号共有14679个,代表了9014个明确基因和610个ESTs。 ⒋文献分析得知共有6415个基因未见有内皮细胞方面的相关报道。 ⒌Go分类后得知这些基因比较多的具有核酸结合、转录因子、激酶、细胞骨架与蛋白合成、转运、连接酶功能。 ⒍PANTHER分析表明,这些基因参与比较多的信号通路是Wntsignalingpathway,Integrinsignallingpathway,Inflammationmediatedbychemokineandcytokinesignalingpathway,Angiogenesis,PDGFsignalingpathway,Huntingtondisease,TGF-betasignalingpathway,EGFreceptorsignalingpathway,FGFsignalingpathway,Parkinsondisease,Apoptosissignalingpathway,p53pathway。 ⒎应用Genomatix网站分析后,可以得出较多的重要基因,这些基因中一部分是:Tp53,IL-1,NFкB,insulin,albumin,apolipoproteinA-Ⅰ,CD54,EGFR,FGF,CRP,TNF,SP1Transcriptfactor。 结论: ⒈成功完成了人脐静脉内皮细胞的基因表达谱分析,得到9014个表达基因和610个ESTs(表达序列标签)。 ⒉文献分析后,有6812个基因在Pubmed数据库中有报道,而其中有6415个基因与内皮细胞之间没有研究报道或较少报道,包含了可能参与内皮细胞重要病理生理功能的基因。 ⒊经生物信息学分析表明:这些基因的功能主要集中在核酸结合、转录因子、激酶、细胞骨架与蛋白合成、转运功能、连接酶功能。参与的信号通路主要与增殖、生长、肿瘤发生发展、血管新生、细胞凋亡等有关。主要的基因有Tp53,IL-1,NFкB,insulin,albumin,apolipoproteinA-Ⅰ,CD54,EGFR,FGF,CRP,TNF,SP1Transcriptfactor,这些基因也大多参与上述的功能。对这些信号通路中的基因和与这些重要基因相联系的基因进行研究具有十分重要的意义。
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